2019年9月14日热带转化医学教育部重点实验室-热带生物医学技术及信息分析李霞教授团队在Molecular Cancer杂志（SCI：10.679）发表题为“Molecular characterization and clinical relevance of m6A regulators across 33 cancer types”文章。

RNA甲基化修饰在多种复杂疾病的发生发展过程中起着重要的作用。N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)是高等生物RNA上最为普遍的修饰。RNA的甲基化主要受到不同类型蛋白的调控，这些蛋白主要包括甲基化转移酶（‘writers’），RNA结合蛋白（‘readers’）以及去甲基化酶（‘erasers’）。随着高通量组学数据的发展，不同类型的RNA甲基化修饰调控子蛋白的识别加深了我们对于复杂疾病中RNA甲基化作用的理解。然而，我们对于这些调控子蛋白在肿瘤中的基因组、转录组及调控组等改变的了解还是十分有限的。

基于此，该项研究系统分析了人类33种癌症类型中>10000肿瘤病人样本中的RNA甲基化调控子的突变、表达改变研究和临床病人生存的相关性。通过生物信息分析，研究者发现RNA甲基化调控子在恶性肿瘤中基因组、转录组发生了广泛的异常。这些RNA修饰调控子的异常扰动了大量癌症相关的分子通路（图1）。此外，研究发现这些RNA修饰调控子间并不是独立发挥功能的，而是通过蛋白质相互作用，协同调控癌症相关的生物学通路。此外，该团队成员通过分析RNA修饰调控子的表达以及病人的生存数据，发现很多RNA甲基化调控子的表达与临床病人的生存密切相关（图2）。特别地，该研究利用生物信息学方法优化筛选发现IGF2BP3在多种肿瘤中高表达，并且与临床病人较差的预后相关，暗示着IGF2BP3在多种癌症中可能扮演着致癌基因的作用。该项研究结果提供了一个有价值的资源用于理解恶性肿瘤等复杂疾病中RNA调控子的异常，对于优化和筛选基于RNA调控子的治疗靶点提供了新的视角。

该项研究工作受到了国家自然科学基金以及热带转化医学教育部重点实验室等项目的资助。李霞教授及其研究团队多年来致力于以生命组学信息学、生物医药大数据与精准医学、表观遗传学与药物组学信息学为主要研究方向，在热带疾病、肿瘤等重大疾病功能基因识别方法的研究中取得了多项重要研究成果，在国外著名生命科学杂志《Hepatology》、《Nucleic Acids Research》、《Briefings in Bioinformatics》、《Bioinformatics》发表多篇SCI研究论文。 

全文链接：https://molecular-cancer.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12943-019-1066-3