个人简介
李永生，男，博士，三级教授，博士/硕士生导师，生物医学信息与工程学院党委副书记、院长。教育部霍英东青年科学奖获得者，海南省千人专项“领军人才”入选者，海南省拔尖人才，海南省“双百人才团队”后备带头人，海南医学院“热带生物医学信息学”A类重点学科后备带头人。目前主持国家自然科学基金3项、省自然科学基金3项，中国博士后特别资助和面上项目等10余项。主要研究成果获中华医学奖三等奖、省政府科学技术二等奖、省高校科学技术一等奖和二等奖等，获得省青年科技奖、校级十大杰出青年、校级科技人才奖、校级优秀科技工作者等荣誉称号。在美国MD安德森癌症研究中心及德州大学奥斯汀分校访问学习3年，获得美国MD安德森癌症研究中心授予的Harold C. and Mary L. Daily Endowment Fund和Ben F. Love Fellowship in Innovative Cancer Therapies奖项。
长期从事医学大数据生物信息学研究，深入研究人类重大疾病中基因型-表型关联这一基本而关键的科学问题，特别关注遗传变异分子标记识别及功能解析、非编码RNA表达调控机制和功能的研究。研究成果发表于《Nature Reviews Genetics》（封面文章）;《Cancer Cell》;《Trends in Biochemical Sciences》（封面文章）;《Hepatology》;《Nature Communications》（ESI高被引论文）;《Nucleic Acids Research》;《Molecular Cancer》;《Cell Reports》;《Cancer Research》;《Annals of Internal Medicine》（ESI高被引论文）等国际著名生命科学杂志，发表SCI论文70余篇，累计SCI影响因子400余点，H-index达到27, 谷歌学术总引用次数达2600余次，单篇最高引用300余次。
作为主要参加者编写国家级规划教材《生物信息学》（第二版、第三版编委）、人民卫生出版社教程《非编码微小分子RNA与心脏疾病》，受邀编写Springer出版社的《Systems Biology in Cancer Research and Drug Discovery》、《Functional Genomics》（第三版）、《Non-coding RNAs in Complex Diseases》及《Computational Epigenetics and Diseases》。担任《BMC Medicine》编辑顾问，《Frontiers in oncology》副主编，《Frontiers in genetics》、《Computational Biology and Bioinformatics》杂志编委，《Nucleic Acids Research》、《Life Sciences》、《Briefings In Bioinformatics》、《Molecular Therapy-Nucleic Acids》、《Journal of Molecular Biology》、《Nanoscale》、《International Journal of Biological Sciences》等10余家国际杂志审稿专家。
教育经历:
2009.9-2014.6, 哈尔滨医科大学, 生物物理学, 博士
2004.9-2009.6, 哈尔滨医科大学, 生物信息, 学士, 大学本科
科研与学术工作经历:
2021.12–至今，海南医学院，生物医学信息与工程学院，党委副书记、院长
2019.12–至今，海南医学院，生物医学信息与工程学院，教授
2015.9–2019.12, 哈尔滨医科大学, 计算生物学教研室, 副教授，博导
2014.7-2015.9, 哈尔滨医科大学, 计算生物学教研室, 讲师
留学经历:
2018.8–2019.10，美国德州大学奥斯汀分校，Dell医学院，四级研究员
2016.9–2018.7, 美国德州大学MD安德森癌症研究中心，系统生物学系，博士后
主持及参与科研项目情况:
1.国家自然科学基金面上项目，恶性肿瘤关键遗传变异介导的RNA结合蛋白调控网络扰动模型构建与分析（31970646），2020年1月-2023年12月，项目负责人，在研；
2.国家自然科学基金地区项目，基于多源数据融合的肿瘤免疫关键调控因子识别及作用机制研究（32060152），2021年1月-2024年12月，项目负责人，在研；
3.海南省重点研发计划项目，基于单细胞测序解析热带病调控因子关键技术研究与应用（ZDYF2021SHFZ051），2021年9月-2023年9月，项目负责人，在研；
4.海南省自然科学基金面上项目，基于多层次功能网络扰动的癌症热点突变优化筛选及功能预测模型研究（820MS053），2020年12月-2023年12月，项目负责人，在研；
5.海南医学院国家级自然科学研究项目培育基金重点项目，重大疾病单细胞测序关键技术研究与应用（JBGS202103），2021年10月-2024年10月，项目负责人，在研；
6.国家卫生健康委员会热带病防治重点实验室开放课题，融合多组学数据优选新冠感染关键RBP分子标记（2022NHCTDCKFKT31001），2021年12月-2023年12月，项目负责人，在研；
7.国家自然科学基金青年项目，融合多组学数据优化筛选恶性肿瘤中表观失调非编码RNA及其功能研究（61502126）， 2016年1月-2018年12月，项目负责人，结题；
8.中国博士后特别资助基金，复杂疾病中长链非编码RNA的识别及其调控机制研究（2016T90309），2016年6月-2019年4月，项目负责人，结题；
9.中国博士后面上项目，恶性肿瘤表观失调长链非编码RNA的鉴定及其功能研究（2015M571436），2015年5月-2019年4月，项目负责人，结题；
10.黑龙江省自然科学基金青年项目，恶性胶质瘤进展相关非编码RNA调控网络及耦合模块挖掘算法研究（QC2015020），2015年7月-2018年7月，项目负责人，结题；
11.黑龙江省博士后基金，整合表观组和转录组识别乳腺癌亚型相关的非编码RNA标记（LBH-Z14134），2014年12月-2019年4月，项目负责人，结题；
12.黑龙江省普通本科高等学校青年创新人才培养计划，基于RNA 结合蛋白调控网络扰动分析优化恶性肿瘤中关键调控因子，2017年10月-2019年12月，项目负责人，结题；
13.哈尔滨医科大学于维汉院士杰出青年基金，2017年8月-2019年12月，项目负责人，结题；
14.国家自然科学基金青年项目，基于多组学数据融合的泛癌中非编码RNA crosstalk模式研究（31601065），2017年1月-2019年12月，主要参与人，结题；
15.国家自然科学基金重点项目，EGFR过表达协同PTEN缺失介导的免疫炎性网络促进胶质母细胞瘤恶性进展的分子机制（91229112），2013年1月-2015年12月，主要参与人，结题；
16.国家自然科学基金培育项目，心血管疾病风险循环非编码RNA（miRNA/LncRNA)识别及其协同调控风险通路功能分析 (91439117) ，2015年1月-2017年12月，主要参与人，结题；
17.哈尔滨医科大学伍连德青年科学基金：基于miRNA 协同调控网络的疾病miRNA和miRNA-mRNA耦合模块挖掘算法研究（WLD-QN1107），主要参与人，结题；
18.黑龙江省研究生创新基金重点项目：融合甲基化组和互作组解析癌症关键的基因和功能通路（YJSCX2012-196HLJ），负责人，结题；
代表性个人奖励情况:
1.2022年第18届霍英东教育基金会高等院校青年科学奖二等奖；
2.2022年第十六届泛珠三角大学生计算机作品赛全国总决赛三等奖（指导教师）；
3.2021年海南省千人专项领军人才入选者；
4.2021年泛珠三角大学生计算机作品赛海南省一等奖（指导教师）；
5.2020年海南医学院优秀共产党员；
6.2020年海南省拔尖人才；
7.2019年第十四届黑龙江省青年科技奖；
8.2018年美国MD安德森癌症研究中心Ben F. Love Fellowship in Innovative Cancer Therapies奖；
9.2017年美国MD安德森癌症研究中心The Harold C. and Mary L. Daily Endowment Fund奖；
代表性教学科研奖励：
1.2022年度黑龙江省教学成果奖，“科教融合、全程多元、知行合一”的生物信息学专业创新教学体系研究与实践, 二等奖，排名第二；
2.2020年度黑龙江省教学成果奖，“适应新医科发展理念，医工结合创办生物信息专业”，一等奖，排名第三；
3.《基于生物数据融合的恶性肿瘤中miRNA-ceRNA复合协同调控模式的研究》，2019，黑龙江省高校科学技术奖，一等奖，排名第三；
4.《癌风险miRNA及协同调控风险通路(pathway)识别》， 2015，中华医学科技奖，三等奖，排名第六；
5.《癌风险miRNA及协同调控风险通路(pathway)识别方法研究》， 2015，黑龙江省政府科学技术奖（自然类），二等奖，排名第六；
6.非编码RNA本体论软件, 2016R11L668233, 原始取得, 全部权利, 2015.9.22 (软件著作权)
7.e-MutPath：基于调控通路改变的关键突变识别分析平台，2021SR1046578, 原始取得, 全部权利, 2021.7.15(软件著作权)
8.DrAS-Net：基于网络的复杂疾病调控选择性剪接突变识别分析平台，2021SR0070974, 原始取得, 全部权利, 2021.1.14(软件著作权)
9.MERIT:复杂疾病遗传变异干扰RNA互作网络识别分析平台，2021SR0197169, 原始取得, 全部权利, 2021.2.4(软件著作权)
10.LncSpA:长链非编码RNA空间转录组在线分析平台，2022SR0880406, 原始取得, 全部权利, 2022.7.1(软件著作权)
11.ROI-Driver：重大疾病遗传变异功能结构优选分析平台，2022SR0986792, 原始取得, 全部权利, 2022.8.3(软件著作权)
12.HVPPI:人类-病毒蛋白互作网络在线分析平台，2022SR1167320, 原始取得, 全部权利, 2022.8.17(软件著作权)
13.TransLnc：长链非编码RNA多肽在线分析平台，2022SR1167319, 原始取得, 全部权利, 2022.8.17(软件著作权)
14.ImmReg：复杂疾病免疫调控因子识别在线分析平台，2022SR1340863, 原始取得, 全部权利, 2022.9.2(软件著作权)
15.PRES：重大疾病RNA编辑功能在线分析平台，2022SR1340864, 原始取得, 全部权利, 2022.9.2(软件著作权)
代表性论文（仅列15篇）：
1.Yongsheng Li#*, Tiantongfei Jiang#, Weiwei Zhou#, Junyi Li, Xinhui Li, Qi Wang, Xiaoyan Jin, Jiaqi Yin, Liuxin Chen, Yunpeng Zhang, Juan Xu*, Xia Li*. Pan-cancer characterization of immune-related lncRNAs identifies potential oncogenic biomarkers. Nature Communications, 2020 Feb 21;11(1):1000.(第一作者+通讯作者，ESI高被引论文, IF=17.694)
2.Yongsheng Li#, Daniel J McGrail#, Juan Xu#, Junyi Li#, Ning‐Ning Liu, Ming Sun, Richard Lin, Rita Pancsa, Jiwei Zhang, Ju‐Seog Lee, Hui Wang, Gordon B Mills, Xia Li*, Song Yi*, Nidhi Sahni*. MERIT: Systematic analysis and characterization of Mutational Effect on RNA Interactome Topology. Hepatology, 2019 Aug;70(2):532-546. (第一作者, IF=17.298)
3.Yongsheng Li#, Brandon Burgman#, Daniel J McGrail, Ming Sun, Dan Qi, Sachet A Shukla, Erxi Wu, Anna Capasso, Shiaw-Yih Lin, Catherine J Wu, S Gail Eckhardt, Gordon B Mills, Bo Li*, Nidhi Sahni*, S Stephen Yi*. Integrated Genomic Characterization of the Human Immunome in Cancer. Cancer Research, 2020 Nov 1;80(21):4854-4867. (第一作者, IF=13.312)
4.Tiantongfei Jiang#, Weiwei Zhou#, Qi Sheng#, Jiaxin Yu#, Yunjin Xie, Na Ding, Yunpeng Zhang*, Juan Xu*, Yongsheng Li*. ImmCluster: an ensemble resource for immunology cell type clustering and annotations in normal and cancerous tissues. Nucleic Acids Research, 2022. (通讯作者,IF=19.160)
5.Haozhe Zou#, Tao Pan#, Yueying Gao#, Renwei Chen#, Si Li, Jing Guo, Zhanyu Tian, Gang Xu, Juan Xu*, Yanlin Ma*, Yongsheng Li*. Pan-cancer assessment of mutational landscape in intrinsically disordered hotspots reveals potential driver genes. Nucleic Acids Research, 2022 May 20;50(9):e49. （通讯作者, IF=19.160）
6.Yu Fu#, Yongsheng Li#, Ensong Guo#, Liang He#, Jia Liu, Bin Yang, Fuxia Li, Zizhuo Wang, Yuan Li, Rourou Xiao, Chen Liu, Yuhan Huang, Xue Wu, Funian Lu, Lixin You, Tianyu Qin, Chaolong Wang, Kezhen Li, Peng Wu*, Ding Ma*, Chaoyang Sun*, Gang Chen*. Dynamics and Correlation Among Viral Positivity, Seroconversion, and Disease Severity in COVID-19: A Retrospective Study. Annals of Internal Medicine, 2021 Apr;174(4):453-461. (并列第一作者，ESI高被引论文, IF=51.598)
7.Dezhong Lv#, Zhenghong Chang#, Yangyang Cai#, Junyi Li, Liping Wang, Qiushuang Jiang, Kang Xu, Na Ding, Xia Li*, Juan Xu*, Yongsheng Li*. TransLnc: a comprehensive resource for translatable lncRNAs extends immunopeptidome. Nucleic Acids Research, 2022 Jan 7;50(D1):D413-D420. （通讯作者, IF=19.160）
8.Yongsheng Li#, Yunpeng Zhang#, Xia Li*, Song Yi*, Juan Xu*. Gain-of-function mutations: an emerging advantage for cancer biology. Trends in Biochemical Science，2019 Aug;44(8):659-674. (第一作者，封面文章, IF=14.264)
9.Song Yi#*, Shengda Lin#, Yongsheng Li#, Wei Zhao, Gordon B. Mills, Nidhi Sahni*. Functional variomics and network perturbation: connecting genotype to phenotype in cancer. Nature Reviews Genetics, 2017 Jul;18(7):395-410. (并列第一作者, 封面文章, IF=59.581)
10.Yongsheng Li#, Brandon Burgman#, Ishaani S Khatri, Sairahul R Pentaparthi, Zhe Su, Daniel J McGrail, Yang Li, Erxi Wu, S Gail Eckhardt, Nidhi Sahni*, S Stephen Yi*. e-MutPath: computational modeling reveals the functional landscape of genetic mutations rewiring interactome networks. Nucleic Acids Research, 2021 Jan 11;49(1):e2.（第一作者, IF=19.160）
11.Yongsheng Li#, Lili Li#, Zishan Wang#, Tao Pan, Nidhi Sahni, Xiyun Jin, Guangjuan Wang, Junyi Li, Xiangyi Zheng, Yunpeng Zhang*, Juan Xu*, Song Yi*, Xia Li*. LncMAP: Pan-cancer Atlas of long noncoding RNA-mediated transcriptional network perturbations. Nucleic Acids Research, 2018 Feb 16;46(3):1113-1123. （第一作者, IF=19.160）
12.Jiwei Zhang#, Tao Pan#, Weiwei Zhou#, Ya Zhang, Gang Xu, Qi Xu, Si Li, Yueying Gao, Zheng tao Wang*, Juan Xu*, Yongsheng Li*. Long noncoding RNA LINC01132 enhances immunosuppression and therapy resistance via NRF1/DPP4 axis in hepatocellular carcinoma. Journal of Experimental & Clinical Cancer Research, 2022. (通讯作者, IF=12.658)
13.Tiantongfei Jiang#, Weiwei Zhou#, Zhenghong Chang#, Haozhe Zou, Jing Bai, Qisen Sun, Tao Pan, Juan Xu*, Yongsheng Li* and Xia Li*. ImmReg: The regulon atlas of immune-related pathways across cancer types. Nucleic Acids Research, 2021 Dec 2;49(21):12106-12118. (共同通讯, IF=19.160)
14.Zishan Wang#, Jiaqi Yin#, Weiwei Zhou#, Jing Bai#, Yunjin Xie, Kang Xu, Xiangyi Zheng, Jun Xiao, Li Zhou, Xiaolin Qi*, Yongsheng Li*, Xia Li*, Juan Xu*. Complex impact of DNA methylation on transcriptional dysregulation across 22 human cancer types. Nucleic Acids Research, 2020 Mar 18;48(5):2287-2302. (共同通讯作者, IF=19.160)
15.Jianping Lu#, Juan Xu#, Junyi Li#, Tao Pan#, Jing Bai, Liqiang Wang, Xiyun Jin, Xiaoyu Lin, Yunpeng Zhang, Yongsheng Li*, Nidhi Sahni*, Xia Li*. FACER: comprehensive molecular and functional characterization of epigenetic chromatin regulators. Nucleic acids research, 2018 Nov 2;46(19):10019-10033. (共同通讯作者, IF=19.160)
