毕小慢,女,1990年出生,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)博士,海南医学院第一附属医院在站博士后,海南医学院生物医学信息与工程学院、生物医药健康大数据中心讲师。海南医学院热带转化医学教育部重点实验室热带生物医学组学大数据团队成员,海南医学院重大疾病生物信息学科研创新团队骨干。担任海南省医学会医学细胞生物学分会青年委员会委员,入选海南省高层次人才、海南省科协青年人才托举工程。
主要研究方向为极端长寿人群的免疫特征、免疫系统疾病的分子机制和癌症系统生物学。共发表24篇SCI论文,其中第一或通讯作者身份(含共同)文章11篇(中科院一区4篇,二区5篇),包括Journal of Hematology & Oncology (IF=28.5)、Aging Cell (IF=11.005)、Clinical and Translational Medicine (IF=10.6)、Theranostics (IF=12.4)、Nucleic Acids Research (IF=14.9)等。研究成果受到Global Times(环球时报)、China Daily(中国日报)、人民网、新华网、中国科学院等10余家主流媒体的关注和报道,荣获“Wiley威立中国开放科学高贡献作者奖”。担任Briefings in Bioinformatics等10余家SCI杂志审稿专家。主持海南省自然科学基金、青年科技英才创新计划项目、博士后研究资助项目等省级项目4项;参与国家自然科学基金、海南省重大、重点研发项目7项;获批软件著作权4项,申请国家发明专利3项。指导学生获国赛二等奖1项、省赛二等奖1项。主讲《生物医学信息学》、《基因组信息学》、《分子系统生物学》、《Linux操作系统与shell编程》等多门生物信息学本、硕、博专业课程,教学效果优秀,荣获院级青年教师教学大赛三等奖,荣获生物医学信息与工程学院2022-2023学年优秀班主任。
教育经历:
1. 2015-09至2020-09,中国科学院北京基因组研究所,基因组学,博士
2. 2012-09至2015-06,哈尔滨医科大学,生物物理学,硕士
3. 2007-09至2012-06,哈尔滨医科大学,生物技术(生物信息学方向),学士
科研与学术工作经历:
1. 2020-12至今,海南医学院,生物医学信息与工程学院,讲师
博士后工作经历:
(1) 2021-03至今,海南医学院第一附属医院,博士后
主持或参加科研项目:
1. 海南省自然科学基金高层次人才项目,单细胞转录组解析阿尔茨海默症性别偏好性机制,2023-03至2026-02,在研,主持
2. 海南省科协青年科技英才创新计划项目,基于单细胞转录图谱解析肿瘤发生的衰老分子特征,2022-09至2025-08,在研,主持
3. 海南省自然科学基金青年项目,基于多源数据融合解析FOX转录因子家族在乳腺癌中的作用机制,2022-04至2025-03,在研,主持
4. 海南省博士后研究项目资助,肿瘤FOX家族及其关键基因FOXM1的多组学分子特征研究,2021-09至2024-03,结题,主持
5. 国家自然科学基金联合基金项目,内皮细胞稳态失衡调控心肌损伤与修复的表观遗传机制研究,2023-01至2026-12,在研,骨干
6. 国家自然科学基金地区项目,RhoE表达下调促进RhoA/ROCK1信号活化在脑积水形成中的作用研究,2023-01至2026-12,在研,骨干
7. 国家自然科学基金面上项目,2型固有淋巴细胞调控嗜酸性粒细胞在腹主动脉瘤发生发展中的作用及机制研究,2022-01至2025-12,在研,骨干
8. 国家自然科学基金地区项目,DNA甲基化相关lncRNA在儿童中枢神经系统肿瘤中的免疫调控机制研究,2022-01至2025-12,在研,骨干
9. 海南省重大科技计划项目(社会发展),基于临床生物样本大数据的肿瘤患者个体化诊疗体系构建,2021-12至2024-12,在研,骨干
10. 海南省重点研发计划项目(社会发展),RhoE抑制ROCK1促室管膜上皮增生影响脑积水形成的临床前研究,2022-09至2025-09,在研,骨干
11. 海南省重点研发计划项目(社会发展),FGFR1介导乳酸化修饰促进胃癌进展的调控机制研究,2022-03至2024-03,结题,骨干
发表论文:
仅列一作/通讯作者文章(#co-first authors. *co-correspondence):
1. Bi X#, Zhang Q#, Chen L#, Liu D, Li Y, Zhao X, Zhang Y, Zhang L, Liu J, Wu C, Li Z, Zhao Y, Ma H, Huang G, Liu X*, Wang Q F*, Zhang R*, NBAS, a gene involved in cytotoxic degranulation, is recurrently mutated in pediatric hemophagocytic lymphohistiocytosis. J Hematol Oncol 2022. 15(1): p. 101. (IF=28.5, 中科院1区Top, 环球时报、中国日报专题报道文章)
2. Bi X#, Zheng D#, Cai J#, Xu D#, Chen L, Xu Z, Cao M, Li P, Shen Y, Wang H, Zheng W, Wu D*, Zheng S*, Li K*, Pan-cancer analyses reveal multi-omic signatures and clinical implementations of the forkhead-box gene family. Cancer Med 2023. 12(16): p. 17428-17444. (IF: 4.0, 中科院2区)
3. Guan X#, Bi X#, Wei R#, Zhao Z#, Lu Z, Jiang Z, Wang X*, Wu D*, Single-cell transcriptomic landscape reveals distinct tumourigenesis and immune microenvironments in secondary radiation-exposed rectal cancer. Clin Transl Med 2024. 14(4): p. e1659. (IF=10.6, 中科院1区Top)
4. Wu D#, Bi X#, Li P, Xu D, Qiu J, Li K*, Zheng S*, Chow K H*, Enhanced insulin-regulated phagocytic activities support extreme health span and longevity in multiple populations. Aging Cell 2023. 22(5): p. e13810. (IF=11.005, 中科院1区Top,获“Wiley威立中国开放科学高贡献作者奖”文章)
5. Xu D#, Zhang C#, Bi X#, Xu J, Guo S, Li P, Shen Y, Cai J, Zhang N, Tian G, Zhang H, Wang H, Li Q, Jiang H, Wang B*, Li X*, Li Y*, Li K*, Mapping enhancer and chromatin accessibility landscapes charts the regulatory network of Alzheimer's disease. Comput Biol Med 2024. 168: p. 107802. (IF=7.7,中科院2区Top)
6. Xu D#, Cao M#, Wang B#, Bi X#, Zhang H, Wu D, Zhang C, Xu J, Xu Z, Zheng D, Chen L, Li P, Wang H, Liu Y*, Jiang H*, Li K*, Epigenetically regulated lncRNAs dissect the intratumoural heterogeneity and facilitate immune evasion of glioblastomas. Theranostics 2023. 13(5): p. 1490-1505. (IF=12.4,中科院1区Top)
7. Xu D#, Xu Z#, Bi X#, Cai J, Cao M, Zheng D, Chen L, Li P, Wang H, Wu D*, Yang J*, Li K*, Identification and functional analysis of N6-methyladenine (m6 A)-related lncRNA across 33 cancer types. Cancer Med 2023. 12(2): p. 2104-2116. (IF: 4.0, 中科院2区)
8. Cao M#, Wang L#, Xu D#, Bi X#, Guo S, Xu Z, Chen L, Zheng D, Li P, Xu J, Zheng S, Wang H, Wang B*, Lu J*, Li K*, The synergistic interaction landscape of chromatin regulators reveals their epigenetic regulation mechanisms across five cancer cell lines. Comput Struct Biotechnol J 2022. 20: p. 5028-5039. (IF=6.0, 中科院2区)
9. Xu D#, Li P#, Zhang C#, Shen Y, Cai J, Wei Q, Cao M, Xu Z, Wu D, Wang H, Bi X*, Wang B*, Li K*, Development of an m6A-Related lncRNAs Signature Predicts Tumor Stemness and Prognosis for Low-Grade Glioma Patients. Stem Cells Int 2024. 2024: p. 2062283. (IF: 4.3, 中科院3区)
10. Xu D#, Ding S#, Cao M#, Yu X, Wang H, Qiu D, Xu Z, Bi X*, Mu Z*, Li K*, A Pan-Cancer Analysis of Cystatin E/M Reveals Its Dual Functional Effects and Positive Regulation of Epithelial Cell in Human Tumors. Front Genet 2021. 12: p. 733211. (IF: 3.7, 中科院3区)
11. Li Y#, Wang C#, Miao Z#, Bi X#, Wu D#, Jin N#, Wang L, Wu H, Qian K, Li C, Zhang T, Zhang C, Yi Y, Lai H, Hu Y, Cheng L, Leung K S, Li X, Zhang F, Li K*, Li X*, Wang D*, ViRBase: a resource for virus-host ncRNA-associated interactions. Nucleic Acids Res 2015. 43(Database issue): p. D578-82. (IF: 14.9, 中科院2区Top)
会议报告:
1. 毕小慢:罕见病新突破:发现遗传性免疫缺陷病HLH的新致病基因,第十五届全国免疫学学术大会,苏州,2023-11-2至2023-11-5(分会场,主持&口头报告)
2. 毕小慢:单细胞水平揭示固有免疫失调在疾病与衰老中的作用机制,第十二届全国生物信息学与系统生物学学术大会,青岛,2023-10-27至2023-10-30(分会场,口头报告)
3. 毕小慢:单细胞分辨率揭示不同种族长寿人群的共同抗衰老免疫机制,第九届全国计算生物学与生物信息学学术会议暨生物医学大数据与人工智能大会,徐州,2023-5-12至2023-5-15(分会场,口头报告)
专利及软件著作权:
1.用于抑制鼻咽癌干性分子标志物的试剂在制备鼻咽癌辅助治疗药物中的应用,2023.5.26(已受理专利)
2.胶质瘤免疫逃逸分子标志物在胶质瘤辅助诊断和治疗中的应用,2023.2.28(已受理专利)
3.鼻咽癌干性分子标志物在鼻咽癌辅助诊断和治疗中的应用,2023.1.18(已受理专利)
4.海南长寿队列关键分子功能解析生物信息学平台,2024SR0445079,原始取得,全部权利,2024.3.28(软件著作权)
5.FGFR1介导乳酸化修饰促进胃癌细胞生长调控系统,2024SR0440400,原始取得,全部权利,2024.3.27(软件著作权)
6.FOX2Cancer:癌症相关FOX基因家族多组学综合信息平台,2023SR1200009,原始取得,全部权利,2023.10.9(软件著作权)
7.Lnc2m6A:N6-甲基腺嘌呤相关lncRNA综合信息平台,2022SR0677015,原始取得,全部权利,2022.5.31(软件著作权)
获奖及荣誉:
1.2023年,Wiley威立中国开放科学高贡献作者
2.2023年,生物医学信息与工程学院2022-2023学年优秀班主任
3.2022年,海南省科协青年人才托举工程入选者
4.2021年,海南医学院生物医学信息与工程学院青年教师教学大赛三等奖
5.2020年,海南省高层次人才
6.2019年,中国科学院大学精准医学前沿研究生学术论坛最佳论文一等奖
7.2019年,第三届基因组医学前沿与健康普惠论坛海报评比三等奖
指导学生项目:
1.2022年人口健康“共享杯”大学生科技资源共享服务创新大赛国家二等奖(指导教师)
2.2022年泛珠三角大学生计算机作品赛海南省二等奖(指导教师)
3.2022年海南医学院大学生创新创业训练计划项目(指导教师)
学术/社会任职:
1.2023-07至今,海南省医学会医学细胞生物学分会,青年委员会委员
2.2022-06至2024-03,海南医学院生物医学信息与工程学院,生物信息学专业秘书
3.2021-09至今,海南医学院生物医学信息与工程学院,2021级生物信息本科班班主任
4.2021-04至2022-07,海南医学院热带转化医学教育部重点实验室,热带生物医学组学大数据(李霞团队)学术秘书
5.2022-06至2024-02,Frontiers in Genetics杂志特刊编辑
6.Briefings in Bioinformatics等10余家SCI杂志审稿专家